洁净室工程采用静态验收方法进行检测时，第三方检测公司只注重清洁这个指标。虽然这样的验收对洁净室工程建设质量有一定判断，但由于验收状态与实际使用状况有很大的差别，洁净室在实际使用效果上也会有很大的差异。有统计显示：正常情况下，动态情况相比于静态情况的粉尘数量更多。当洁净室工程过滤系统有堵塞异常是，送风量会大幅度下降，从而降低洁净度。由此可见，动态环境下检测和验收装修工程比静态环境下更为可靠。不过，我国动态验收法还不如国外成熟，验收结果的准确性还有待提高。
装修公司在设计洁净室工程时会选用一些先进的设计软件，提高设计和施工的效率。三维设计技术是现在装修设计比较常用的技术手段，它具有两大优势：一是可以将洁净室装修施工图纸简化，提高施工效率；二是可以降低洁净室工程施工成本。市场上三维设计软件很多，下面主要以Solidworks三维工程软件为例进行分析。
洁净室工程空调系统非常复杂，有的装修公司会采用中央空调系统控制不同的净化车间，有的装修公司则在每个净化车间都采用独立的空调系统，具体的设计方案需要参考工厂对装修的要求。有的工厂净化车间只分布于一个楼层，对应的洁净室工程空调系统相对简单，而有的工厂净化车间分布于不同的楼层，对应的空调系统设计较为复杂。由此可见，洁净室装修公司必须要具备丰富的经验，才能设计出合理的空调系统方案。
洁净室工程机电安装风险管理主要是指在对风险进行有效识别和科学度量的基础上，制定相应的项目风险管理策略措施和管理方法，实现对项目风险的有效控制。根据实践经验，在机电安装施工阶段，通过有效的风险管理，可以有效避免项目的风险事件，消除各种不良后果，从而达到机电安装工程的总体目标。在医药行业，光学行业和电子行业的洁净室工程中，通过风险管理的方法已经在机电安装施工阶段获得显著的成效，既可以提高机电设备安装的效率，又能提高设备安装的质量。