普通新风系统由于回风等问题容易引发交叉污染，据此，医院引入新风系统时，将要更加考虑满足医院内空气品质及新风量的需要的同时，避免交叉感染等现象。尤其对于隔离病房，为了防止病人携带的病菌扩散到走廊及其他病房，造成其他人员的感染，医院新风系统会将隔离病房设置成相对于走廊为负压。在其卫生间设置排风，排风引入到医院新风机组；隔离病房排风利用负压局部排风单元处理后排出室外对于普通病房，也将其设置为负压。送、排风系统与隔离病房相似。

建筑密闭性好，易出现因湿气大而发霉的现象，新风净化系统可除去室内的湿气，避免室内家具、衣物发霉。医院专用新风系统的排风系统采用1:8模式，能迅速将室内垃圾、新家具、烟草等散发出来异味排出室外，防止厨房、卫生间出现异味，让空气整日都清新。

医院新风系统与传统医院空调新风的区别 （1）传统空调新风系统没有通风路径设计，没有系统的排风措施，无法有效排除室内污浊空气，系统存在很大的交叉感染风险 （2）采用动力分布式通风系统，实现各个房间对新风量的按需控制； （3）通过专用的智能控制系统软件，在远程监控台中对所有主机进行调节和控制，并可监测各主机的运行状态，主机可实现智能化感应调节，能有效对系统进行远程监控和管理。

用室外新鲜的空气代替室内污浊的空气，降低室内污染物浓度，提升室内空气品质； 第二、排除医院建筑室内存在的或病毒，减少交叉感染； 第三、减少医院建筑中空调系统的能耗，具有节能意义。